2016年，云南省農業融資擔保有限公司經省人民政府批準成立，由省財政廳履行出資人職責，累計投入資本金29.77億元。公司嚴格按照《財政部 農業部 銀監會關于做好全國農業信貸擔保工作的通知》（財農〔2017〕40號）和《財政部 農業農村部 銀保監會 人民銀行關于進一步做好全國農業信貸擔保工作的通知》（財農〔2020〕15號）的要求開展各項工作，充分發揮政策性農業融資擔保機構作用，主動服務云南省高原特色現代農業產業發展和鄉村振興戰略，構體系、強合作、廣宣傳、拓業務，現已成為全省注冊資本規模最大、政策性最強，分支機構數量最多、專注服務群體最廣、業務區域全覆蓋的政策性擔保公司。
聚焦農業產業發展，堅持政策性定位
公司嚴格執行中央“雙控”要求。服務范圍始終圍繞我省農業產業發展，聚焦農業生產及與農業生產直接相關的一二三產業融合項目。服務對象聚焦種養殖大戶、家庭農場、農民合作社、農業社會化服務組織、小微農業企業等農業適度規模經營主體。擔保金額嚴格控制在10—300萬元。擔保費率不超過0.8%，其中，政策性幫扶項目不超過0.5%。自2022年6月起，按照《云南省人民政府關于貫徹落實扎實穩住經濟一攬子政策措施的意見》和省委省政府、省財政廳的要求，對已構建30%風險分擔的縣（市、區），對融資擔保主體承擔的擔保費實行“零費率”政策。
緊盯重點地區及產業發展，提供優質服務
公司主動服務我省“3815”戰略，突出對57個鄉村振興重點幫扶縣的擔保支持力度，緊緊圍繞黨中央、國務院關于確保糧食安全和重要農產品供給的工作部署要求，緊盯重點農業產業，圍繞茶葉、花卉、蔬菜（含食用菌）、水果、堅果（核桃、澳洲堅果）、咖啡、中藥材、牛羊（含奶業）、生豬、煙草、甘蔗和天然橡膠重點領域，做好優質融資擔保服務，支持“一縣一業”“一村一品”做優做強。
加強風險防控能力，保障經營持續健康
公司始終把防范和控制風險放在更加突出的位置加以管理，正確處理風險與業務的平衡關系，不斷簡化業務辦理流程、優化業務審批模式，逐步建立健全全流程風險管理體系。著力建立內部監督檢查機制，對公司擔保業務持續開展全方位內部審計，建立內部巡查和內部審計“雙循環”監督體系，全面強化員工規矩意識、紀律意識和廉潔意識。確保公司業務依法合規、健康有序運行。
構建風險分擔機制，政銀擔合作不斷深入
公司認真履行財政資金撬動金融杠桿的職能，加強與各級政府、金融機構的通力合作，爭取政策和金融支持。已構建起政銀擔風險分擔，聯合支持農業產業發展的格局。
機構體系覆蓋全省，人才隊伍建設穩定
公司按照財政部提出的“總—分”模式要求，堅持“準確定位、專注農業，垂直短鏈、下沉基層”原則，以業務發展為導向，結合農業經濟區劃和農業融資擔保輻射半徑合理，布局設立分支機構。現已在全省16個州（市）設立了43個分支機構，實現了機構與業務的雙覆蓋。